Cell Res:北京基因组所合作揭示 RNA 甲基化催化反应 R -loop 形成及转录终止

2021-10-18 20:48:51 来源:
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R-loop 是一种由 RNA:DNA 杂合多肽和脱氧核糖核酸 DNA 组成的比如说核酸形态,在遗传物质和酿酒酵母生物的遗传物质组里分布普遍且普遍存在。R-loop 在很多关键性的生物化学处理过程里发挥举足轻重新功能,包括肝线粒体标记、RNA诱导、DNA 损伤重建以及遗传物质组保持稳定性等,但其如何被准确诱导的系统亦然不清楚。m6A 标记作为哨兵 RNA 上丰度最高者的标记类型,普遍参与动物的发育、免疫、生殖线粒体更新、脂肪分裂、以及生成和转移等全人类处理过程。然而,现在亦然不清楚 m6A 是否能作为 R -loop 里 RNA 组分的本源特征来诱导 R -loop 水平,进而发挥各种生物化学新功能。国防科工委北京遗传物质组研究实践中所杨运桂、任捷与清华大学生科院孙前文里的团队合作研究实践中,辨认出 m6A 能保持稳定 R-loop 的逐步形成,进而诱导遗传物质RNA的有效延后。这一实践中以《m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination》篇名于 10 月 12 日在线刊登于《线粒体研究实践中》(Cell Research)杂志。研究实践中的团队首先通过白点分子性状和免疫荧光核心技术,辨认出敲低 m6A 当季基转移酶 METTL3 显着增加 R -loop 水平,且该诱导功用依赖 METTL3 当季基转移酶活性。随后,的团队成员借助高效小分子色谱联合质谱核心技术,辨认出相比于生殖细胞结合的 RNA(caRNA),R-loop 的 RNA 组分有更加富集的 m6A 标记。有利于借助基于脱氧核糖核酸 DNA 建库的 DNA:RNA 杂合多肽免疫合共沉淀生物医学核酸核心技术(ssDRIP-seq),辨认出下调的 R -loop 主要富集在RNA延后区域,R-loop 发生变化相对与 m6A 的距离和标记水平系统性。为了探究 m6A 对 R -loop 诱导的生物化学新功能,研究实践中的团队绘制了 RNA 酵素RNA位点的分光镜图解,并在 MYC、ACTIN 遗传物质上透过多种RNA活性扫描,辨认出 m6A 促进 R -loop 逐步形成是RNA延后先决条件的关键性步骤,可以防止 RNA 酵素的RNA通读。最后,的团队成员构建了针对RNA通读的报告遗传物质系统,通过 m6A 标记位点的突变有利于证实 m6A 对于 R -loop 逐步形成及RNA延后的关键性功用。该研究实践中辨认出了 m6A 酪氨酸标记的合共RNA诱导新功能,探究了 RNA 酪氨酸标记对肝线粒体形态的阻碍,以及 R-loop 形态里的 RNA 组分被标记后对其自身稳态的诱导系统,阐释了 m6A 通过保持稳定 R-loop 而促进RNA正常延后的自然现象,为有利于研究实践中 m6A 与 R-loop 的诱导系统和相应生物化学新功能提供了基本的核心技术和原理支撑。该研究实践中得到了里国科学院战略性先导科技专项、国内自然科学以及国内重点生产蓝图等基金捐献。原始引自:Xin Yang, Qian-Lan Liu, Wei Xu, et al. m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination. Cell Research (2019).
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